|
" تايپينگ مولکولي سويه هاي کلستريديوم پرفرنجنس جدا شده از دامهاي مشکوک به انتروتوکسمي و سالم به روش MLVA "
حياتي، معصومه
| شماره شناسایی
|
:
|
18884524
|
| شماره مدرک
|
:
|
۶۷۶۹۶
|
| نام عام مواد
|
:
|
[گزارش نهایی -عادی]
|
| شناسه افزوده
|
:
|
حياتي، معصومه
|
|
|
:
|
پرديس، عليرضا
|
|
|
:
|
صادق زاده اکبرآبادي، صفر
|
|
|
:
|
تهمتن، يحيي
|
|
|
:
|
معنويان، محسن
|
|
|
:
|
تدين، کيوان
|
|
|
:
|
شهرياري، رضا
|
| عنوان اصلي
|
:
|
تايپينگ مولکولي سويه هاي کلستريديوم پرفرنجنس جدا شده از دامهاي مشکوک به انتروتوکسمي و سالم به روش MLVA
|
| نام نخستين پديدآور
|
:
|
حياتي، معصومه
|
| عنوان اصلي به زبان ديگر
|
:
|
Molecular typing of Clostridium perfringens isolated from suspected enterotoxemic and healthy livestock by MLVA method
|
| وضعیت انتشار
|
:
|
کرج: موسسه تحقيقات واکسن وسرم سازي رازي، ۱۴۰۴
|
| فروست
|
:
|
شماره ثبت ۶۷۶۹۶ مورخ ۱۴۰۴/۰۵/۰۵۶۷۶۹۶
|
|
|
:
|
شماره طرح : 2-84-18-032-000471
|
|
|
:
|
سامانه سمپات
|
| توصیفگر
|
:
|
Clostridium perfringens
|
|
|
:
|
MLVA
|
|
|
:
|
molecular typing
|
| خلاصه یا چکیده
|
:
|
باکتری کلستریدیوم پرفرنجنس علاوه بر نقش آن بعنوان فلور روده حیوانات سالم، عامل بیماریهای مهم و خطرناکی نیز در انسانها و دامها می باشد از جمله بیماری انتروتوکسمی که سالانه خسارت زیادی به صنعت دامپروری می زند. بررسی تنوع ژنتیکی و یا قرابت سویه های جدا شده این باکتری با روشهای تایپینگ مولکولی می تواند قدمی در شناخت اپیدمیولوژی بیماری و ساختار جمعیت این باکتری ها در منطقه باشد. هدف از این تحقیق تایپینگ مولکولی سویه های کلستریدیوم پرفرنجنس جدا شده در استان فارس از گروههای سالم و بیمار دامها به روش MLVA می باشد.
پس از احیای سویه های کلستریدیوم پرفرنجنس موجود از قبل و جداسازی سویه های جدید از گروههای سالم و مشکوک به انتروتوکسمی و مشخص نمودن توکسینوتیپ و تعدادی از ژنهای حدت شامل netB , tpeL, cpe و β2 ، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی 8 لوکوس VNTR ، آزمایش PCR انجام شد و سایز باندهای ایجاد شده پس از الکتروفورز با استفاده از نرم افزار BioNumerics مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج تایپینگ74 سویه موجود در این تحقیق شامل 27 سویه جداسازی شده در گروه کلینیکی، 43 سویه جداسازی شده در گروه سالم، 3 سویه واکسن و strain 13 (gene bank) ، 71 پروفایل مجزا به دست آمد. نتایج کلاسترینگ سویه ها با رسم درخت minimum spanning tree وجود 5 کلاستر و دو سینگلتون بود. در کلاسترهای ایجاد شده گروه بیمار و سالم، توکسینوتیپهای مختلف، هر سه نوع دام و نمونه های جدا شده در زمانهای مختلف به صورت پراکنده وجود داشتند. شاخص تفکیک کلی در این روش 99/0 براورد گردید. جهت مقایسه سویه ها آزمایش MLD برای توکسینهای اپسیلون و بتا نیز انجام شدکه در مورد توکسین اپسیلون بالاترین تیتر مربوط به یک سویه کلینیکی تیپ D بوده و پس از آن تیتر سویه واکسن قرار داشت. بقیه سویه های کلینیکی و غیر کلینیکی تیتری کمتر از سویه واکسن داشتند. تیترMLD سویه کلینیکی تیپ C جداسازی شده نیز نسبت به سویه واکسن کمتر بود. به طور کلی تایپینگ مولکولی MLVA تنوع ژنتیکی بالایی را در سویه های کلستریدیوم پرفرنجنس نشان میدهد.
|
|
|
:
|
Clostridium perfringens, despite its role as a normal flora of intestine, is the agent of important and dangerous diseases in human and livestock. Enterotoxaemia is one of these diseases causing significant mortality in livestock annually. Analysis of genetic diversity or relatedness of isolates with molecular typing methods can be helpful for understanding the epidemiology of these infections and observing population structures of these bacteria. The aim of this study was molecular typing of C. perfringens isolated in Fars province from healthy and clinical suspected enterotoxemic livestock by MLVA method. Collection of previously isolated and preserved C. perfringens along with new collected isolates from healthy and diseased livestock were evaluated for toxin type and some virulence genes including cpe, tpeL, netB, and β2. Genetic typing of isolates was done using specific primers for amplification of eight VNTR loci. PCR was done and electrophoresis banding patterns of fragments were analyzed by BioNumerics software. The results of typing revealed 71 distinct MLVA profiles from 74 strains, including 27 clinical isolates, 43 non clinical isolates, three vaccine strains and strain 13 (gene bank). Clustering of isolates according to the minimum spanning tree showed 5 different clusters, excluding three orphan isolates. Clinical and non-clinical isolates were scattered in all clusters and no defined cluster related to health status, date of isolation, kind of host and place of isolation was detected. The total diversity index of our typing method was estimated as 0.99. To compare the isolates according to epsilon and beta toxin production, MLD test was done. The results showed the highest titer of epsilon toxin for one of clinical isolates after which the titer of type D vaccine strain was obtained. Other clinical and non- clinical isolates showed lower MLD titer compared to vaccine strain. The MLD titer of beta toxin in type C vaccine strain was higher than clinical isolate. Overall MLVA molecular typing method shows high genetic diversity among C. perfringens isolates
|
| |